| タイトル | 著者 | ページ |
| 巻頭カラーグラフ | | |
| プロローグ | | |
| 第一章 ウナギという生き物 | | |
| 魚らしくない魚／ウナギをつかまえる／雄と雌／ウナギの一生 | | |
| 第二章 ウナギと出会う | | |
| 海底二万マイルごっこ／南の島へあこがれる／巨人ヨハネス・シュミット／タッカー仮説／太平洋のウナギ産卵場調査／航海の「番頭」をする／世界一周航海／千びきの小型レプトセファルス | | |
| 第三章 新たな発見を求めて | | |
| ビギナーズラック／魔法の石／とれないわけは？／夢の計画／調査船駿河丸／二つの仮説／潜水艇ヤーゴ | | |
| センターカラーグラフ | | |
| 第四章 プレレプトがとれた | | |
| なぜ失敗したのだろうか？／淡青丸の航海／海にすむウナギ／幻のボルネンシス／ウナギの来た道／ウナギの親せき／ウナギのイブ／はらぺこ犬作戦／プレレプトセファルス | | |
| 第五章 卵の発見 | | |
| やはり仮説は正しかった／もうやめる？ まだ続ける？／卵の壁 なぜとりにくいのか？／親ウナギ捕獲作戦／仮説はまちがっていた？／ついにとれた、ウナギの卵！／親ウナギをつかむ | | |
| 第六章 終わりのない航海 | | |
| 潜水艇しんかい６５００／ウナギＵＦＯ計画／ウナギとわたしたち／ウナギは減ってしまった／研究する意味 | | |
| エピローグ | | |
| ウナギプロフィール | | |
